Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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TCOF1Q13428 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCOF1Q13428 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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