Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DEFB1P60022 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms