Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MCCD1P59942 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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