Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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