Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRIM23P36406 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms