Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms