Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD8P13378 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms