Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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