Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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