Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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CCDC88CQ9P219 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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CCDC88CQ9P219 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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CCDC88CQ9P219 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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CCDC88CQ9P219 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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