Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNPDA2-203ENST00000507917 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF713-206ENST00000633730 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 LPXN-203ENST00000528954 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRAMEF2-201ENST00000240189 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073349.2-201ENST00000427545 1603 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 QRSL1-201ENST00000369044 2158 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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KRTAP9-4Q9BYQ2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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KRTAP9-4Q9BYQ2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031663.3-201ENST00000617473 1794 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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KRTAP9-4Q9BYQ2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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KRTAP9-4Q9BYQ2 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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KRTAP9-4Q9BYQ2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA32-201ENST00000331780 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 CFAP61-207ENST00000389656 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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