Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CCDC142Q17RM4 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC142Q17RM4 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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