Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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RTL8BQ17RB0 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RTL8BQ17RB0 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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