Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTCH1Q13635 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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