Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms