Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms