Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2E1P29083 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E1P29083 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms