Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TRAF3IP2-207ENST00000368761 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC004990.1-202ENST00000454234 1965 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC021087.3-201ENST00000565521 2881 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms