Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TMEM225BP0DP42 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms