Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.9 ms