Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HMGB1P1B2RPK0 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms