Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CNIH4Q9P003 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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