Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms