Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARRDC4Q8NCT1 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms