Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF182Q8N6D2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms