Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms