Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LINC02139-201ENST00000612023 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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