Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CUL3Q13618 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CUL3Q13618 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CUL3Q13618 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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CUL3Q13618 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CUL3Q13618 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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