Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 PDE8A-208ENST00000557957 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 SSUH2-201ENST00000317371 2561 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 THRB-206ENST00000416420 2571 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 LRIT2-201ENST00000372113 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 MAP3K7-204ENST00000369329 4911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 LINC01600-201ENST00000624527 2434 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 FCGR2B-202ENST00000358671 2115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 UTP14A-201ENST00000394422 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 SLC12A3-202ENST00000438926 5567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 STK26-201ENST00000354719 3179 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ATP6V1H-207ENST00000520188 1967 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 PEX12-204ENST00000613219 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ZUFSP-202ENST00000368576 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 STRADA-231ENST00000638708 2153 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ADAM22-201ENST00000265727 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 FBN2-201ENST00000262464 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 CENPO-206ENST00000473706 4272 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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UBE2V1Q13404 MYOZ3-201ENST00000297130 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ABL2-211ENST00000512653 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 CHRNA7-224ENST00000637183 2912 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 BEND3P1-202ENST00000449695 2762 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 CICP26-201ENST00000425003 2448 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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UBE2V1Q13404 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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UBE2V1Q13404 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ZFYVE28-206ENST00000508471 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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UBE2V1Q13404 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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UBE2V1Q13404 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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