Protein–RNA interactions for Protein: P98182

ZNF200, Zinc finger protein 200, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF200P98182 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF200P98182 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF200P98182 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms