Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms