Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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