Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT1P21579 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT1P21579 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms