Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HOXD8P13378 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD8P13378 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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