Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VTNP04004 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VTNP04004 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VTNP04004 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VTNP04004 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VTNP04004 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VTNP04004 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VTNP04004 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VTNP04004 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VTNP04004 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VTNP04004 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VTNP04004 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VTNP04004 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VTNP04004 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VTNP04004 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms