Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LTAP01374 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LTAP01374 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LTAP01374 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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LTAP01374 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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LTAP01374 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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LTAP01374 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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LTAP01374 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LTAP01374 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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