Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LINC00474Q9P2X8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms