Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARHGAP28Q9P2N2 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms