Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
THUMPD1Q9NXG2 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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