Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms