Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRIM48Q8IWZ4 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRIM48Q8IWZ4 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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