Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 TCTE1-201ENST00000371504 616 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 HKR1-222ENST00000591417 525 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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FAM208BQ5VWN6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 NTM-201ENST00000374784 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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FAM208BQ5VWN6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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FAM208BQ5VWN6 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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FAM208BQ5VWN6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FAM208BQ5VWN6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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