Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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TCOF1Q13428 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
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TCOF1Q13428 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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TCOF1Q13428 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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TCOF1Q13428 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCOF1Q13428 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCOF1Q13428 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TCOF1Q13428 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCOF1Q13428 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCOF1Q13428 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCOF1Q13428 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCOF1Q13428 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCOF1Q13428 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCOF1Q13428 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TCOF1Q13428 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCOF1Q13428 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCOF1Q13428 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCOF1Q13428 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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