Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 FAM13C-201ENST00000422313 1963 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PDE4C-203ENST00000447275 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ACTR1A-201ENST00000369905 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 EXTL3-AS1-201ENST00000501224 3691 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AL683813.1-201ENST00000435597 3018 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SIDT2-220ENST00000628876 2609 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PAX6-243ENST00000638903 2620 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 OSBPL7-201ENST00000007414 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ABCB9-204ENST00000392439 3791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ABCB9-206ENST00000442028 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 OLFML3-202ENST00000369551 1934 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ZNF700-203ENST00000622593 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ARHGEF34P-201ENST00000483587 4532 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MIS12-206ENST00000611091 2691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 OR10H5-202ENST00000642092 7044 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LINC02211-203ENST00000642022 2816 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ZP1-201ENST00000278853 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 GRIA1-209ENST00000518783 5233 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 PYGL-205ENST00000532462 2711 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 CFAP69-213ENST00000497910 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ANKRD26P1-201ENST00000566201 3921 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 DDX4-201ENST00000353507 2778 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AL392185.1-201ENST00000419620 395 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AL354707.1-201ENST00000615168 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ADCY4-201ENST00000310677 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC008966.1-201ENST00000502171 2367 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 CDKL1-201ENST00000216378 2209 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 HS6ST2-202ENST00000370836 4441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 DCT-201ENST00000377028 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AS3MT-201ENST00000369880 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 ZNRD1ASP-219ENST00000448093 2296 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 KIF26B-201ENST00000366518 12113 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 UNC93A-202ENST00000366829 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 MADD-206ENST00000402192 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 LCTL-201ENST00000341509 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 RUNX2-AS1-201ENST00000563807 1513 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 NFASC-201ENST00000339876 10333 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
UBE2V1Q13404 PLCD4-206ENST00000450993 3232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms