Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AL592287.1-201ENST00000637598 2074 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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