Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HERVK_113P63121 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms