Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LMO4P61968 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LMO4P61968 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms