Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK8P49336 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms