Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GDF5P43026 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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