Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPOP42166 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms